Archa Bohemica je název pro přírodní část stráně v botanické zahradě, kde jsme ponechali cenné přírodní partie a některá méně hodnotná místa přetvořili na nové ukázkové biotopy. Jsou zde biotopy skalní – Dolní Povltaví, které ukazuje biotopy skalního kaňonu Vltavy pod Prahou, Český kras, kde se soustředíme na květenu vápenců jihozápadního okraje Prahy, hadce ČR, kde ukazujeme různé hadcové biotopy od podhorských po teplomilné. Je zde i biotop bílé stráně, což jsou opukové svahy bohaté na vzácné rostliny. Součástí jsou i dvě mokřadní plochy, slatina představuje zejména květenu polabských černav. Slanisko má největší zeměpisný záběr a předvádí i panonské slanomilné druhy.
Celou expozici doplňuje žulový úvoz se záhonem plným velmi vzácných rostlin z celé ČR a v okolí zvoničky jsme soustředili druhy, které již v ČR patří mezi vyhynulé druhy.
Všechny rostliny pocházejí z přírody a protože je zde pěstujeme v téměř přirozených podmínkách, tak mají velkou genofondovou hodnotu a některé z nich vracíme i zpět do přírody.